Восствновление предковой последовательности


Здесь приведено выравнивание реальной и восстановленой предковых последовательностей:
                                                                    

ECNFO_O            1 atgaaatacattggagcgcacgttagtcgtgct--ggcggtctggcaaat     48
                     |.|..|:..||||:|:||..|.|||||  |.||  ..||.|||..|..||
Predok             1 AsGtgakTratTgkakcgtccttTagt--tccTtcACCgwtCTccCttAT     48

ECNFO_O           49 gccgcaattcgcgccgccgaaatcgacgcaaccg-cgtttgccttgttc-     96
                     |.|.||||||||..|.|..:|||.|||||.|.|| .||..|:|    || 
Predok            49 GtCmcAaTTcGcttCaCwcraaTrgAcGCCatCGtgGtaGgsc----Tcc     94

ECNFO_O           97 --accaaaaaccaacgtcagtggcgtgccgcaccgctcacgac-----gc    139
                       |||..|.||||||.|:|:|:||||     |.|||.|.||||     |.
Predok            95 aGacCctAgaCCAacttsAktkGCGt-----akcgcGcCcGaCarTatGa    139

ECNFO_O          140 aaaccatcgatgaattcaaagccgcctgtgaaaaatatcactacacatcg    189
                     |..|::||....|.|.|..|||||....||||:|..|..|.|||||||||
Predok           140 aCgCsrTcttacaCTscGkAGCCGgaattgAAwagaAcgatTaCACATcg    189

ECNFO_O          190 gcgcaaattcttccccacgacagttatct-gattaacctcgg-acatccg    237
                     ||.||||||||||.||.|||:.::|..|| |||  |.||||| |.|||||
Predok           190 GCCcAaatTcTTCtCcccGasGskTgccTCgat--aaCtcgGtAtatCCG    237

ECNFO_O          238 gtcactgaagctctggaaaaatcgcgcgatg---cctttatagatgaaat    284
                     |.||..||.|.||:.|||::..||   |.||   ||.|:||.|.||...|
Predok           238 ggcAgaGACgtTckagAArrggcg---gttgtakcCctwaTcGttGggTt    284

ECNFO_O          285 gcagcgttgcgaacagctggggctttctttgctcaacttccaccctggca    334
                     ||..|.:||||.||||.||||..||.||         ||::|||   |||
Predok           285 gccacckTgCGcAcAggTgggCaTtact---------ttymacc---gca    322

ECNFO_O          335 gcca-----tctgatgcagatttcagaaga-------ggattgcc--ttg    370
                     :|||     ||   |.|..|.|||..:|||       ||.|.|||  |.|
Predok           323 kCcACacactC---ttCccACTtcktwAgatGTtatcggttggccGaTcG    369

ECNFO_O          371 -cgcgtattg-ccgaatccatcaacattgcgctggataaaactcaaggtg    418
                      |||||||.| |.|||..|| |.||..||.|.|||  ..|||.||:..||
Predok           370 ccGcgTATggtcgGaaGTCa-ccACcCTGtGatgG--tCAAcAcawwatg    416

ECNFO_O          419 tgac--agcggtgatagaaaacaccgccggtcagggcagtaacttagggt    466
                     |:.|  ||:|.|.|.||:||||||..|||||.||||||||||....|:||
Predok           417 tkcccraGsGtTaAAaGwaaaCAcwacCgGtgaGgGCaGtAawcccgrgt    466

ECNFO_O          467 ttaaattcgaacatctcgcg---------gcgattatcgacggcgtggaa    507
                     |||||||.:.|||   :|||         |.||.|:.||  ||.||  ||
Predok           467 tTaaATtrsgaca---ygcGayaGAtmTwgTgagtwgcg--gGGgt--aA    509

ECNFO_O          508 gataaatcccgcgtcggcgtctgcattgatacc-----tgccatgctttc    552
                     |  ||.|||..||..:||||||||||   |||:     ||  ||||.||.
Predok           510 G--aacTCCttCgggsgCgTcTgCat---TacsacgrGtg--ATGCAtta    552

ECNFO_O          553 gctgccgggtatgatttgc-gtactccagccgaatgcgagaaaacattcg    601
                     ||...|.|:.|||| .||| |||||.|.|||||:||.|...||.||||||
Predok           553 gCaatCagraATGA-ctgcagTacTaCgGcCGAmTGGggCCaAtcaTtcg    601

ECNFO_O          602 cggattttgcccgtactgtcgg---ctttaagtatctgcgcgggatgcac    648
                     |||||.|||||||  :|| |||   |.|.||||||||..||..|||||  
Predok           602 CgGATGtTGcccG--mtG-cggcgtCatCaaGTATctaggCmagaTgc--    646

ECNFO_O          649 cttaa----cgatgcgaaaagcacctttggcagccgcgttgaccgccatc    694
                       |:|    |||||||.||.|..|.:||||.|...|.|||.||||.||||
Predok           647 --twagTcycGatgcGcaAgggccaytTgGgaatagagTttacCGtcatC    694

ECNFO_O          695 atagcctcggtgaaggcaatatc-----ggtcatgatgcgttccgctgga    739
                     ...|   |.|||  ||.||.|||     |.|..||.|..||..|||.|.|
Predok           695 sagG---cAgtG--GGgaAaatCaTtTaGcttTTGcTttGtckCgCAGTA    739

ECNFO_O          740 tcatgcaggacgaccgtttcga---cggcattccgctgatcctcgaaacc    786
                     |.||||||||||..|||:.|:|   ||||   :||.:.||||..|.||.|
Predok           740 traTgCAggAcGgtCGtwCcsAtGtcGgc---sCGtwcatCCatGCAatc    786

ECNFO_O          787 atcaac--ccggatatctgggcagaagagatcgcctggctgaaagcgcaa    834
                     ||  ||  |||.|||||||||..||.||.|:.|.:|||.|||:.|.|.||
Predok           787 at--ACctccgaaTaTCtGGGtggAtGatawrgamTgGgTGArtgGggaa    834

ECNFO_O          835 caaactgaaaaagcggtagcctga    858
                     ...|||...|.|.||.||.|..:|
Predok           835 AtsAcTctyatATcgttatcggkA    858


Identity:     531/924 (57.5%)
Предковая последовательность была восстановлена с помощью программы dnaml, команда "5".

На главную страницу третьего семестра


©Сухорукова Мария 2005